Naast het remmen van de groei en reproductie van micro-organismen, heeft vacuümdeoxygenatie nog een belangrijke functie om voedseloxidatie te voorkomen. Omdat vettig voedsel veel onverzadigde vetzuren bevat, wordt het geoxideerd door de werking van zuurstof, waardoor het voedsel slecht smaakt en bederft. Bovendien veroorzaakt oxidatie ook het verlies van vitamine A en vitamine C, en de onstabiele stoffen in voedselkleuring worden beïnvloed door zuurstof om de kleur donkerder te maken. Daarom kan deoxygenatie effectief voedselbederf voorkomen en de kleur, het aroma, de smaak en de voedingswaarde behouden.
